Pa arrêtés ministériels sont désignés sites Natura 2000:
– Embiez – cap Sicié (zone spéciale de conservation)
– zones alluviales de la confluence Dore-Allier (zone spéciale de conservation)
– vallées et coteaux thermophiles au nord de Clermont-Ferrand (zone spéciale de conservation)
– Cézallier (zone spéciale de conservation)
– massif cantalien (zone spéciale de conservation)
– zones humides de la Planèze de Saint-Flour (zone spéciale de conservation)
– gorges de la Rhue (zone spéciale de conservation)